Le lycée de Fontaines propose:
- des formations générales et technologiques:
- SECONDE GENERALE ET TECHNOLOGIQUE : modules d'explorations : Economie, EATDD, aide individualisée,
options facultatives
- BACCALAUREAT GENERAL SERIE SCIENTIFIQUE (BAC S) spécialité Biologie-Ecologie Agronomie et Développement Durable.
- BACCALAUREAT TECHNOLOGIQUE STAV
Spécialités :
- Technologies des productions agricoles
- Technologies des aménagements et valorisation des espaces
- BREVET DE TECHNICIEN SUPERIEUR option ACSE
- des filières professionnelles:
- BACCALAUREAT PROFESSIONNEL 1ère année
- Seconde professionnelle Productions Animales
- Seconde professionnelle Productions Végétales
- BACCALAUREAT PROFESSIONNEL CGEA (Classes de 1ère et de terminale) spécialité : SDE
Le Lycée est également site de formation pour le CFA71 qui propose:
- BACCALAUREAT PROFESSIONNEL CGEA par apprentissage (Classes de 1ère et de terminale) : spécialités : SDE ou SDC
- BREVET DE TECHNICIEN SUPERIEUR par apprentissage : Options : PA ou APV